Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4E171 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B4E171 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B4E171 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms