Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B4DGG1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B4DGG1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DGG1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DGG1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DGG1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DGG1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DGG1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DGG1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DGG1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DGG1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DGG1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DGG1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DGG1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DGG1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DGG1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DGG1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DGG1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DGG1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DGG1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DGG1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DGG1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
B4DGG1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms