Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM1B2RUZ4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms