Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A6NL46 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
A6NL46 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A6NL46 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A6NL46 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A6NL46 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A6NL46 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NL46 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NL46 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NL46 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NL46 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NL46 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NL46 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NL46 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NL46 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NL46 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A6NL46 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms