Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RGPD3A6NKT7 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms