Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3CA6NKF2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms