Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSDA5PKW4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms