Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SNX8Q9Y5X2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms