Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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HDGFL3Q9Y3E1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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HDGFL3Q9Y3E1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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