Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1BQ9UPS6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms