Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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RAB23Q9ULC3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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RAB23Q9ULC3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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RAB23Q9ULC3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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RAB23Q9ULC3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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RAB23Q9ULC3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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RAB23Q9ULC3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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RAB23Q9ULC3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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RAB23Q9ULC3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB23Q9ULC3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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