Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD1Q9UIS9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms