Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNA3Q9UI47 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms