Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms