Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

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Length 977 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC4Q9UBN4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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