Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DNMT3BQ9UBC3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DNMT3BQ9UBC3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms