Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D2AQ9P2K1 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms