Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ABI3Q9P2A4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms