Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MBD5Q9P267 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms