Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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SH3BP4Q9P0V3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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