Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PARVAQ9NVD7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms