Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BPIFA1Q9NP55 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms