Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRDM12Q9H4Q4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms