Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF541Q9H0D2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF541Q9H0D2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF541Q9H0D2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF541Q9H0D2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF541Q9H0D2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF541Q9H0D2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF541Q9H0D2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF541Q9H0D2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF541Q9H0D2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms