Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMBRA1Q9C0C7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AMBRA1Q9C0C7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms