Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA4CQ9C0C4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms