Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms