Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GABARAPL3Q9BY60 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABARAPL3Q9BY60 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms