Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CARD11Q9BXL7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms