Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BRIP1Q9BX63 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRIP1Q9BX63 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms