Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM106CQ9BVX2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms