Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf50Q9BV19 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms