Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF4Q99607 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.5 ms