Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIK3R4Q99570 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms