Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKP4Q99569 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKP4Q99569 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms