Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC7Q96M83 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms