Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTV1Q96GA3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTV1Q96GA3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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