Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TM4SF18Q96CE8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms