Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX9

MIB2, E3 ubiquitin-protein ligase MIB2, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2Q96AX9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MIB2Q96AX9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms