Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
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PTPRUQ92729 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRUQ92729 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
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