Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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CLDN19Q8N6F1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
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CLDN19Q8N6F1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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CLDN19Q8N6F1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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CLDN19Q8N6F1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN19Q8N6F1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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