Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LTBP4Q8N2S1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms