Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HAPLN4Q86UW8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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