Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OTOP1Q7RTM1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms