Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP31Q70CQ4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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