Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C3orf38Q5JPI3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms