Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HLA-BQ31612 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms