Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
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