Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFA9Q16795 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms