Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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